معايير الإبلاغ عن البيانات الإنزيمية (STRENDA) هي مبادرة للمعايير الدنيا للمعلومات تركز بشكل خاص على وضع مبادئ توجيهية للإبلاغ (وصف البيانات الوصفية) للتجارب الإنزيمية. ويدعم هذه المبادرة معهد بيلشتاين للنهوض بالعلوم الكيميائية. تضع STRENDA معايير للنشر لبيانات نشاط الإنزيمات و STRENDA DB، وهو نظام إلكتروني للتحقق من صحة بيانات نشاط الإنزيم وتخزينها. وتأسست المؤسسة في عام 2004 نتيجة تحليل مفصل لنوعية البيانات الإنزيمية في المنشورات المكتوبة والإلكترونية.
المنظمة
يقود المشروع 15عالمًا من جميع أنحاء العالم يشكلون لجنة STRENDA ويدعمون العمل بخبرات في الكيمياء الحيوية وتسميات الإنزيمات والمعلوماتية الحيوية وبيولوجيا الأنظمة والنمذجة والإنزيمات الميكانيكية والبيولوجيا النظرية.
المبادئ التوجيهية للإبلاغ
تقترح المبادئ التوجيهية تلك المعلومات الدنيا اللازمة للإبلاغ الشامل عن البيانات الحركية والمتوازنة المستمدة من بحوث أنشطة الإنزيم بما في ذلك الظروف التجريبية المقابلة. يُقترح تناول هذه المعلومات الدنيا في منشور علمي عند الإبلاغ عن بيانات أبحاث علم الأنزيمات لضمان وصف مجموعات البيانات بشكل شامل. يسمح هذا للعلماء ليس فقط بمراجعة البيانات وتفسيرها وتأكيدها ولكن أيضًا لإعادة استخدام البيانات لنمذجة ومحاكاة مسارات التحفيز الحيوي. بالإضافة إلى ذلك، تدعم المبادئ التوجيهية الباحثين لجعل بياناتهم التجريبية قابلة للتكرار وشفافة.
اعتباراً من مارس 2020، أدرجت أكثر من 55 مجلة دولية للكيمياء الحيوية إرشادات STRENDA في تعليمات مؤلفيها كتوصيات عند الإبلاغ عن بيانات علم الأنزيمات. مشروع STRENDA مسجل لدىFAIRsharing.org والمبادئ التوجيهية هي جزء من معايير مجتمع FAIRDOM لبيولوجيا الأنظمة.
الطلبات
STRENDA DB
STRENDA DB عبارة عن منصة تخزين وبحث على شبكة الإنترنت تضمنت المبادئ التوجيهية وتتحقق تلقائيًا من البيانات المقدمة حول الامتثال لمبادئ STRENDA التوجيهية وبالتالي ضمان اكتمال مجموعات بيانات المخطوطات وصلاحيتها. تمنح مجموعة بيانات صالحة رقم سجل STRENDA (SRN) ويتم إنشاء صحيفة وقائع (PDF) تحتوي على جميع البيانات المقدمة. يتم تسجيل كل مجموعة بيانات في Datacite وتعيين DOI لإحالة البيانات وتتبعها. بعد نشر المخطوطة في مجلة تمت مراجعتها من قبل النظراء، أصبحت البيانات في STRENDA DB مفتوحة. STRENDA DB هو مستودع أوصت به re3data و OpenDOAR. يتم حصاده بواسطة OpenAIRE. يوصى بخدمة قاعدة البيانات في تعليمات المؤلفين لأكثر من 10 مجلات للكيمياء الحيوية، بما في ذلك مجلة الكيمياء البيولوجية و eLife و PLoS. وقد أشير إليه كأداة موحدة للتحقق من صحة بيانات حركات الإنزيم وتخزينها في منشورات متعددة الجوانب. كشفت دراسة حديثة تناولت أحد عشر منشوراً، بما في ذلك المعلومات الداعمة، من مجلتين رئيسيتين عن وجود إغفال واحد على الأقل في كل واحدة من هذه الورقات. وخلص المؤلفون إلى أن استخدام STRENDA DB في النسخة الحالية سيضمن إتاحة حوالي 80٪ من المعلومات ذات الصلة.
إدارة البيانات
ويعتبر مصرف STRENDA DB أداة لإدارة البيانات البحثية من قبل مجتمع البحوث (مثل مشروع الاتحاد الأوروبي CARBAFIN).
المراجع
روابط خارجية
- https://fairsharing.org/FAIRsharing.ekj9zx،سجل في FAIRSharing.org لـ STRENDA DB،
